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联盟成立于2007年11月28日，在时任公安部公共信息网络安全监察局局长李昭的提出的“齐心协力，共同促进我国信息网络安全事业发展，为我国经济建设、信息化建设保驾护航”的指导下，由陕西省、吉林省、云南省、湖南省、广东省、广西自治区、上海市、重庆市以及广州市、杭州市、包头市、南通市、茂名市等十三个省市协会、学会共同倡议发起成立。
联盟目前的最高权力机构每年召开一次的会员大会或会员代表大会（即“联盟年会”）；会员大会之下设立“理事会”，作为会员大会或会员代表大会的常设机构，理事会成员单位由会员大会选举产生，“理事会”由理事会成员单位派出的代表组成；联盟在年会举办期间专门设立主席团，决策年会主要议题，联盟的日常工作由联盟秘书处负责（秘书处设在广东省网络空间安全协会，由会长黄丽玲女士担任联盟秘书长）。由秘书长主持联盟秘书处日常工作的开展。
目前，联盟不向入盟的盟员收取会费。联盟秘书处所需活动经费由秘书长的所在机构提供，其它活动经费由盟员单位自愿提供赞助。
联盟的会员单位具有规格高、阵容强的特点。自成立以来，得到了社会各届的热烈欢迎和拥护，组织规模逐年发展壮大。截至2015 年9 月，发展到了覆盖全国29个省份近81家盟员单位，核心会员企业近3万家，汇聚了全国最有影响力、最具实力的互联网企业、信息网络安全企业，及知名高校、科研院所、行业权威专家、学者，在行业内具有广泛的代表性和权威性。
联盟先后聘请了公安部科技委主任、原公安部部长助理李润森为名誉主席；原中央宣传部常务副部长、全国政协常委龚心瀚、全国人大常委王宋大、工信部信息安全协调司原司长周宝源、人民网总编、中国经济报刊协会会长、中国国际公共关系协会副会长、《人民日报》原副总编张虎生，广东省警察协会会长、原广东省公安厅常务副厅长张圣钦为联盟顾问。